宝宝咳嗽的时候不能进行灌肠治疗，原因如下：
1、灌肠药物的成分比较复杂，可能造成肠黏膜的损伤，形成溃疡而继发感染。
2、灌肠会对孩子的心理造成影响，孩子有恐惧感，可能会影响排便功能。
3。孩子咳嗽可以给予口服对症治疗，药物的临床用法、用量大都是以口服为主做的临床试验，灌肠的药物没有处方经验，会导致用药量不准，影响疗效。