肠系膜淋巴结炎多由上呼吸道感染所致，引起上呼吸道感染的细菌或病毒，同时也引起了消化道的感染，进而导致消化道附近的淋巴结(即肠系膜淋巴结)发炎、肿大，有些类似于孩子感冒，引起扁桃体肿大。因为肠道及附近淋巴结有炎症，故会引起疼痛，腹痛位于脐周，有时可伴有发烧。
肠系膜淋巴结炎是儿童常见的一种疾病，只要治疗了原发病，或者对症治疗，一般短期内(1-2周)均可痊愈。