幼儿的阴茎短小，一般这种情况在临床中诊断为矮小阴茎和包茎。矮小阴茎不需要治疗，对健康和长大后的生育能力没有影响，可能与肥胖有关，包茎则需要作包皮切除术治疗才能治愈。
另外，小孩生殖系统发育较为落后，通常在青春期才开始充分发育，因此阴茎短小不必要过度担心，不要随意的和别的孩子比较，以免造成孩子的心理阴影。