婴儿肛周脓肿的原因，常见于以下方面：
1、皮肤娇嫩：小儿肛周皮肤和直肠黏膜娇嫩，易被干燥的粪块刮伤，或被尿便浸渍和粗糙尿布擦伤；
2、感染的因素：由于肛门部位有伤口，易继发感染，感染可向肛门周围蔓延，导致发病；
3、炎症的因素：小儿肛周脓肿常起源于肛门腺窝及肛门腺的炎症，开始为肛门直肠周围组织反应性的蜂窝组织炎，以后炎症局限形成脓肿。
肛周脓肿多集中在肛门附近的皮下及直肠黏膜下，如不及时治疗，脓肿可穿入直肠周围组织，形成各种直肠瘘。