疱疹性咽峡炎和手足口病，都是由肠道病毒感染引起的急性呼吸道传染病，并且传染性强，常见区别如下：
1、疱疹性咽峡炎：常继发于急性上呼吸道感染，也可单独发病，突发高热体温可达40℃，伴有咽痛、食欲差或拒食，在口腔悬雍垂、软腭及咽腭弓处，有数颗至数十颗灰白色小疱疹。疱疹也可出现在口腔其他部位，疱疹破溃形成溃疡，身体其他部位无疱疹，一般无全身并发症；
2、手足口病：表现为低热、咽痛、食欲差，口腔黏膜有散在疱疹及溃疡，手、足、臂、腿及臀部出现疱疹，少数患儿可出现严重全身并发症。