宝宝睡觉时候摇头晃脑，常见原因如下：
1、缺乏维生素D和钙：因为这个年龄段生长发育比较快，饮食又比较单调，很容易因为维生素D缺乏导致体内处于缺钙的状态，在缺钙的情况下，神经肌肉的兴奋性度比较高，所以会表现为烦躁、哭闹、出汗多、夜惊。典型的症状就会出现摇头，有时候会出现所谓的枕后脱发圈，也是佝偻病早期的表现；
2、过敏因素：有些宝宝是过敏体质，可能与湿疹、奶癣有关，也可能会对气味或者对某些花粉发生过敏反应，有时候就会出现皮肤过敏性皮疹，造成睡眠时不安稳，有时候会出现摇头晃脑的情况；
3、其他因素：这个年龄段新陈代谢比较旺盛，晚上睡觉的时候可能盖得多、穿得多，在出汗的情况下会影响睡眠的舒适度，就会出现翻来覆去或者摇头的现象；
总而言之，宝宝晚上睡觉的时候摇头晃恼总有原因，家长可以要带宝宝到儿保门诊请医生协助分析，必要的时候可以做检查明确诊断。