婴儿指(趾)纤维瘤病属于长期间断性治疗，可以选用糖皮质激素类药物或抗肿瘤代谢药物，部分患者还可以选用手术方式，进行结节切除术等。
一、药物治疗
1、糖皮质激素类：
（1）曲安奈德：局部注射可减小指趾纤维瘤，减轻临床症状。还用于治疗各种皮肤病、过敏性鼻炎、关节痛、支气管哮喘、肩周炎、腱鞘炎、滑膜炎、急性扭伤、类风湿性关节炎等。可能产生的不良反应：肥胖、高血压、低血钾、多毛、浮肿等。在使用部位可能出现滞后性皮肤发白、轻度肌肉萎缩。
（2）倍他米松：用于缓解13岁及以上儿童及成人激素敏感性皮肤病出现的炎症和瘙痒症状。局部外用副作用相对较小。
2、抗肿瘤代谢药：
（1）氟尿嘧啶：具有对抗肿瘤代谢，促进肿瘤消退作用，临床多以局部注射为主。对本药过敏、感染(水痘)者、免疫力低下者禁用。
二、手术治疗
结节切除术：结节长期不消退或出现侵袭性生长或生长较快以及出现关节畸形和功能障碍时采取可外科手术处理，可行结节的广泛切除术。但术后常易复发。