小儿慢性胃炎发病原因极为复杂，病因迄今尚未完全明确，考虑主要与幽门螺杆菌感染、胆汁反流、长期服用刺激性食物和药物、神经精神因素、全身慢性疾病影响有关。其他因素包括环境、遗传、免疫、营养等因素也与发病有关。
一、主要病因
1、幽门螺杆菌感染：已证实幽门螺杆菌的胃内感染是胃炎的主要病因，在活动性、重度胃炎中幽门螺杆菌检出率很高。
2、胆汁反流：各种原因引起胃肠道动力异常，十二指肠胃反流，反流的胆盐刺激减低了胃黏膜对离子通透的屏障功能，使得胃液中氢离子得以反弥散进入胃黏膜引起炎症。
3、长期服用刺激性食物和药物：如粗糙、过硬、过冷、过热、辛辣的食品，经常暴饮、暴食，饮浓茶、咖啡，服用阿司匹林等非甾体抗炎药及类固醇激素类药物。
4、神经精神因素：持续精神紧张、压力过大，可使消化道激素分泌异常。
5、全身慢性疾病影响：如慢性肾炎、尿毒症、重症糖尿病、肝胆系统疾病、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等。
6、其他因素：如环境、遗传、免疫、营养等因素均与发病有关。
二、诱发因素
小儿腹部受凉可以引起胃肠型感冒，常见的临床表现为腹泻、腹痛，如果不及时治疗或者治疗不当，导致病情迁延，可以发展为慢性胃炎。