引起小儿急性肾小球肾炎发生的病因大致可分为两类，一类为A组β溶血性链球菌急性感染后引发的，另一类为除溶血性链球菌以外其余病原体、细菌等引发的感染，临床上多数病例是属于第一类病因导致。
1、A组β溶血性链球菌：以上呼吸道感染、扁桃体炎最为常见，脓皮病和皮肤感染次之。
2、其他病因：非链球菌(包括其他的葡萄球菌、革兰阴性杆菌等)、病毒(流感病毒、柯萨奇病毒、EB病毒、HBV等)、肺炎支原体及疟原虫等。