1、实验室检查：
（1）血常规：细菌感染可见白细胞计数增高、血沉增快、C反应蛋白升高，可判断患者有无感染，军团菌毒素可引起抗利尿激素分泌异常，可见血钠、血钙、血磷降低。
（2）尿常规：镜下血尿阳性，一半患儿出现蛋白尿，判断患者有无肾脏损害。
（3）生化功能：血清肌酐、尿素氮快速进行性升高，常伴代谢性酸中毒和水、电解质平衡紊乱。内生肌酐清除率进行性下降，滤过钠排泄分数高于正常，可判断病情严重程度。
（4）军团菌培养：主要通过痰、血液等作为培养物，分离培养军团菌菌株是诊断军团菌感染的金标准。
2、尿液军团菌抗原检测：操作简单、快捷、灵敏度高，目前用于军团菌的快速检测。
3、免疫学检查：军团菌感染1周后可检出IgM抗体，较早判断军团菌感染。2周左右可检测出IgG抗体，感染后1月左右达到高峰。
4、影像学检查：军团菌感染的胸部X线片无特异性，主要用于观察病情变化。临床症状好转而影像学恶化是本病的特点之一，可以作为辅助判断。