小儿卡氏肺囊虫肺炎是一种常继发于免疫缺陷的机会感染性疾病，由卡氏肺囊虫感染引起，可通过空气及飞沫传播。本病可通过空气、飞沫传播，少数也可通过胎盘感染，好发于早产儿、原发及继发性免疫功能低下的小儿、恶性肿瘤患儿、艾滋病患儿，可由免疫功能低下、恶性肿瘤诱发。
一、主要病因
小儿卡氏肺囊虫肺炎是由卡氏肺囊虫所引起的。而卡氏肺囊虫是一种原虫，正常情况下人和动物的卡氏肺囊虫感染率很高，但仅少量寄居于人体肺内，为非致病微生物，只有在机体免疫机能障碍时才能致病。卡氏肺囊虫可以滋养体与包囊形式存在，其遗传物质、形态以及对药物的敏感性与真菌及原虫类似。其发病机理可能是免疫缺陷的机体经卡氏肺囊虫感染后,不能迅速产生对应的抗体。
二、诱发因素
1、早产儿免疫系统发育不全，免疫功能低下。
2、原发及继发性免疫功能低下的小儿，包括艾滋病、器官移植接受免疫抑制剂或激素治疗、先天免疫缺损及长期营养不良、腹泻、严重感染、贫血。
3、恶性肿瘤，尤其是淋巴瘤、白血病、网状内皮系统的恶性肿瘤并接受皮质类固醇、细胞毒性药物及广谱抗菌素治疗。