小儿营养性缺铁性贫血是由于体内铁的吸收与排泄失衡所造成，先天储存铁不足、生长发育旺盛导致血容量增加需要的铁量增加。多发生在6个月至2岁的婴幼儿，婴幼儿体内储存的铁被用尽而饮食中的铁含量不够，消化道对铁的吸收不足以补充血容量和红细胞的增加，即可发生贫血。
1、先天储铁不足：胎儿从母体获得的铁以妊娠最后3个月最多，故早产、双胎或多胎、胎儿失血和孕母严重缺铁等均可使胎儿储铁减少。
2、铁摄入量不足：这是缺铁性贫血的主要原因。人乳、牛乳、谷物中含铁量均低，如不及时添加含铁较多的辅食，容易发生缺铁性贫血。
3、生长发育因素：婴儿期生长发育较快，5个月时和1岁时体重分别为出生时的2倍和3倍。随着体重增加，血容量也增加较快，1岁时血循环中的血红蛋白增加2倍。未成熟儿的体重及血红蛋白增加倍数更高，如不及时添加含铁丰富的食物，则易致缺铁。
4、铁的吸收障碍：食物搭配不合理可影响铁的吸收。慢性腹泻不仅铁的吸收不良，而且铁的排泄也增加。
5、铁的丢失过多：正常婴儿每天排泄铁量相对比成人多，每1ml血约含铁0.5mg，长期慢性失血可致缺铁。如肠息肉、美克尔憩室、膈疝、钩虫病等可致慢性失血，用不经加热处理的鲜牛奶喂养的婴儿可因对牛奶过敏而致肠出血(每天失血约0.7ml)。