小儿慢性支气管炎的主要病因包括先天性因素和后天性因素，如病毒、细菌感染、先天性畸形等，好发于先天性心脏病者、营养不良者、低体重者。
一、主要病因
1、先天因素：儿童鼻腔相对短小，鼻道狭窄，鼻黏膜柔嫩，并富有血管感染使黏膜肿胀易造成堵塞。气管支气管较成人短而且狭窄，缺乏弹力组织，支撑作用差，肺含血量比含气量少，易于感染。肺泡吞噬细胞功能不足，免疫力低下容易发生呼吸道感染。
2、有害气体和有害颗粒：如烟雾、粉尘、刺激性气体(二氧化硫、二氧化氮、氯气、臭氧等)，这些理化因素可损伤气道上皮细胞，使纤毛运动减退，巨噬细胞吞噬能力降低，导致气道净化功能下降，同时刺激黏膜下感受器，使副交感神经功能亢进，使支气管平滑肌收缩，腺体分泌增多，杯状细胞增生，黏液分泌增加 ,气道阻力增加。
3、感染因素：病毒、支原体、细菌等感染是慢性支气管炎发生发展的重要原因之一，病毒感染以流感病毒、鼻病毒、腺病毒和呼吸道合胞病毒为常见；细菌感染常继发于病毒感染，常见病原体为肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、卡他莫拉菌和葡萄球菌等。这些感染因素同样造成气管、支气管黏膜的损伤和慢性炎症。
4、过敏因素：过敏因素与慢性支气管炎的发病有一定关系，初步看来，细菌致敏是引起慢性支气管炎速发型和迟发型变态反应的一个原因，变态反应使支气管收缩或痉挛、组织损害和炎症反应，继而发生慢性支气管炎。
二、诱发因素
1、气候因素：气候变化、特别是寒冷空气能引起黏液分泌物增加，支气管纤毛运动减弱。在冬季，患者的病情波动与温度和温差有明显关系，自主神经功能失调，也可能是本病的一个内因，大多数患者有自主神经功能失调现象。部分患者的副交感神经功能亢进，气道反应性较正常人增强。
2、维生素缺乏：维生素C缺乏机体对感染的抵抗力降低，血管通透性增加；维生素A缺乏，可使支气管黏膜的柱状上皮细胞及黏膜的修复功能减弱，溶菌酶活力降低，易罹患慢性支气管炎。