小儿溃疡性结肠炎治疗，根据病情轻重，常用的治疗方法有药物治疗、饮食治疗、情绪保持、生活规律等。主要治疗为对症治疗减缓症状，改善营养状况。常用的治疗药物有糖皮质激素、免疫抑制剂、生物制剂、抗生素等，经上述治疗无好转者需要手术治疗。
一、药物治疗
1、5-氨基水杨酸类、磺胺类：适用于轻度或中度患者，对停药后易复发者，可选用小剂量长期维持治疗。对激素及5-氨基水杨酸、磺胺类治疗欠佳时，可考虑使用免疫抑制剂6-巯基嘌呤。
2、甲硝唑：可抑制肠道厌氧菌，并有免疫抑制、影响白细胞趋化等作用。该药可明显减轻里急后重症状，对有肛周疾病和瘘管的患者疗效明显。
3、抗生素：有继发感染者可用，常用药物有庆大霉素、青霉素、氨苄西林等。
4、硫唑嘌呤、左旋咪唑：可以抑制自身免疫反应，但不能长期使用，症状缓解后遵医嘱停药或用其他药替代治疗。
5、生物制剂：上述治疗不能控制症状，病情反复时需用生物制剂治疗，儿童常用英夫利昔单抗。
二、手术治疗
1、手术治疗适应症：长期对症治疗，症状不缓解，严重影响生长发育者；在对症治疗过程中发生了合并症，如结肠狭窄、结肠穿孔、大出血及中毒性巨结肠者须急诊手术。
2、根据患儿年龄、病程长短、病变程度、症状轻、重、缓、急来选择不同的手术方式，如结肠次全切除、结肠全切，永久性肠造瘘等。
三、其他治疗
1、维持营养，纠正水、电解质紊乱，改善贫血和低蛋白血症。
2、必要时可给肠道外营养，使肠道休息，症状好转后可给要素饮食。