婴儿脑脊膜膨出一旦确诊，首选手术治疗。因为脑脊膜膨出，会引起神经功能障碍、智力低下及明显脑积水，所以手术治疗可以改善出现的症状。手术治疗的目的是封闭颅骨缺损，切除膨出的囊性组织，并将脱出的脑组织还纳入颅腔，防止进一步神经损害。手术时机推荐：尽早手术，出生数周甚至数天即可施行手术。如果术前已经发生颅内感染，需要先抗感染治疗。