小儿疱疹性咽峡炎一般都是病毒感染引起的，特别是单纯疱疹病毒或柯萨奇病毒。首先给抗病毒口服液，同时口服小儿牛黄清心散，喷用康复新液或西瓜霜喷剂；也可以口服复合维生素B和蒙脱石散。如果小儿流涎、食欲下降严重，需要输液治疗。如果合并细菌感染，需要同时口服抗生素，如果青霉素不过敏的话，可以选择阿莫西林克拉维酸钾治疗。