婴儿肛瘘多为低位单纯性肛瘘，一般具有一定的自愈性，但是也是需要配合药物处理的，大概需要三周以上的时间。比如每次排便后用温盐水清洗肛周部位，配合百多邦喷雾剂外用，起到消炎杀菌的作用。然后针对肛瘘使用红油膏纱条或者京万红软膏外涂，可以祛腐生肌、消炎止血。而且应该注意调理好婴儿的肠道功能，避免腹泻或者是便秘。