洋地黄、异丙肾上腺素、多巴胺等正性肌力药及强效利尿药应避免应用。左室压差大于50mmHg，可以外科或消融切除肥厚的室间隔肌。经皮腔间隔心肌化学消融术是将无水乙醇经导管注入供应室间隔心肌组织的间隔支血管，造成人为的间隔心肌梗死，以缓解左室流出道梗阻，是近年治疗HCM的一种新方法。正性肌力药可增加左室压力阶差，使临床症状加重，并可引发室性心律失常。强效利尿药减轻心室前负荷，致左室流出道梗阻加重。