月经来了40天没干净，需至医院检查血HCG、尿HCG、血常规，以及B型超声检查。如果血尿HCG阳性，B型超声检查提示宫内妊娠，考虑流产可能。如果B型超声提示输卵管妊娠等异位妊娠，血尿HCG阴性，可能为功能失调性子宫出血。育龄妇女、年轻妇女，需行诊断性刮宫术明确诊断，刮出组织送病理检查。大部分女性由于增生期子宫内膜所致，可给予孕激素，月经后半周期口服治疗。