输卵管堵塞的女性自然怀孕是否可以继续妊娠，需要根据受精卵着床位置来决定。如果已经在子宫中正常着床，可以继续妊娠。如果是出现宫外孕，则无法继续妊娠。因为存在输卵管堵塞或者是不通畅的女性，会导致卵子和精子结合的通道出现异常，但并不影响卵子、精子形成受精卵及胚胎的质量。