胚胎停止发育原因有许多，胚胎停止发育的原因是比较多的，胚胎的因素，如果在怀孕早期出现胚胎停止发育，有50%—60%是由于胎儿的染色体发育异常，也是一种自然淘汰的方法，这种胎儿是不会发育成正常孩子的，在怀孕早期就自然流产了首先在怀孕早期受到一个外力的作用，有毒物的接触，还有就是，精子卵子形成的胚胎本身，发育不良，没有产生足够的雌孕激素和绒毛膜促性腺激素来维持这排正常的，发育，还有就是，由于其他的疾病的问题，比如子宫腔容量不够有，子宫纵隔，或者是子宫内膜息肉，或者是子宫肌瘤，还有就是患有某种疾病，技术水平的问题，甲状腺功能的障碍，还有免疫抗体的问题都会引起，胚胎停止发育，还有染色体异常。