由于滴虫能吞噬精子，可引起不孕症，影响生活质量，可并发滴虫性尿道炎、膀胱炎、肾盂炎，滴虫性阴道炎的危害主要是会令人难受及疼痛，阴道毛滴虫长期存在于阴道内，消耗或吞噬阴道上皮细胞内的糖原，阻碍乳酸生成，不仅破坏阴道的弱酸性环境，还有可能引起阴道细胞发育异常，诱发癌前期病变。