花椒水不能治疗霉菌。
霉菌性阴道炎是白念珠菌感染引起的阴道炎，是由于阴道内环境改变且自身抵抗力下降导致的，一般要使用抗菌药物来治疗。治疗前遵医嘱可以使用碳酸氢钠清洗外阴及阴道，然后阴道内用药来治疗霉菌。
花椒水具有祛湿、散寒、止痒的作用，可以适当缓解霉菌性阴道炎引起的外阴瘙痒，但是不能根治霉菌感染。