内分泌失调与月经不调的区别很大，月经不调只是内分泌失调的一部分。
内分泌失调是内分泌系统的常见疾病，涉及到内分泌的所有腺体，垂体、性腺、下丘脑、甲状腺、肾上腺等。内分泌失调除导致月经不调外，还会导致肾上腺皮质功能紊乱、甲状腺功能紊乱等，内分泌失调概念比月经不调更广泛。月经不调只是小部分，内分泌失调主要一个或多个腺体激素分泌紊乱。月经不调主要是女性雌激素、孕激素分泌紊乱。相对容易控制，病变组织主要是子宫和卵巢。