怀孕43天孕囊已经着床了能排除宫外孕，如果没有着床还需要再做检查才能明确。
女性怀孕43天后可以前往医院做B超、彩超等相关检查，查看子宫内有没有孕囊，以此来排除宫外孕的情况。如果有孕囊存在的，就可以诊断为不适宫外怀孕；如果没有孕囊的存在，可以在一周左右后复查，一般在怀孕60天的时候，出还没有检查出孕囊，就需要考虑是宫外孕的可能了。
如果是宫外孕，最好住院观察，避免宫外孕破裂发生出血，严重者可能出现休克。