诊断子宫内膜异位症的最佳方法通常是就医，在医生的指导下进行检查。
B超，对子宫内膜、膀胱、直肠、膀胱等疾病进行确诊的一种主要检查手段；CT和MRI，可用于检查肛门静脉及阴道内深层病变，不能用于初步检查；血清ca125检查，严重子宫内膜异位伴有囊肿破裂、子宫腺肌病、慢性炎症的患者会出现ca125增高；腹腔镜，目前世界上对子宫内膜异位的最好的诊断手段。