下面长小水疱可能是生殖器疱疹。生殖器疱疹是因单纯疱疹病毒Ⅰ型或者单纯疱疹病毒Ⅱ型感染引起的性传播疾病，主要是通过性生活传播而导致的，普通人群不用过于担心。
患者发现下面长小水疱之后，应及时就医进行初步诊断。生殖器疱疹发病较快，水疱迅速融合成团，疱液比较清亮，局部会有灼痛感。症状严重者应尽快治疗，通过外用阿昔洛韦软膏加口服阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦等抗病毒药物治疗。
夫妻一方诊断为生殖器疱疹病毒之后，治疗期间要禁止性生活，避免生殖器疱疹通过性传播。