卵巢囊肿可能误诊，但几率相对较小。
在所有的妇科肿瘤里，最常见的就是卵巢癌。囊性囊肿分为囊性、囊实性和实性三种类型。特别是恶性的卵巢上皮癌，伴随着与之对应的肿瘤有关的抗体。但有些恶性肿瘤，不会出现明显的抗体增高或者是不正常的情况，所以在手术中，很容易出现错误的情况。大部分的错误诊断都是因为癌症的本质而导致的。而手术后的组织学检查，则是最好的判断依据。总的来说，在手术之前或治疗之前，误诊的可能性很低。