念珠菌是一种真菌，通常引起阴道炎的是念珠菌中的白色念珠菌。白色念珠菌为条件致病菌，正常人体都会存在上述霉菌，由于人体防御机制和菌群相互制约作用，不会发生霉菌性尿道炎。但是，当患者长期患病、全身衰竭、长期使用抗生素及激素等情况下，会导致正常菌群失调，从而发生霉菌性尿道炎。另外，长期使用导尿管、造瘘管等亦可直接产生霉菌性尿道炎。