囊肿的形成过程与子宫内膜有关。在正常情况下，子宫内膜生长在子宫腔里面，每个月脱落一次，形成月经。脱落的子宫内膜碎片随血液逆流到卵巢，就如随风漂流的蒲公英种子，落到卵巢生根发芽。而当女性处于生理期时，异位的子宫内膜会在激素的作用下反复局部脱落流血，形成囊肿。