通常巧克力囊肿大于五公分以上时，由于剧烈的活动，或者同房等原因，就可能会引起巧克力囊肿破裂，这时就会引起剧烈的下腹部疼痛。所以就必须赶紧去医院急诊就诊，然后行腹腔镜微创手术，或者直接行开腹手术，将破裂的巧囊切除，而且还要将盆腔内的巧囊液完全清洗干净。