可采用如下办法治疗。药物治疗：采用药物来对抗或抑制卵巢的周期性内分泌刺激。手术治疗：卵巢上发生的巧克力囊肿，病变体积往往较大，发生在其他部位的子宫内膜异位结节，直径在2厘米以上者，不易用药物控制，要把它切开，把里面的这个囊肿剥掉。