药物流产不干净，是要做B超检查一下，看一看残留物体积，如果体积比较小，是可以在应用药物帮助排出残留物。如果体积比较大，只能依靠清宫手术来去除宫腔残留物。药物流产是有一定的失败几率，在一开始做药物流产以前就应当知情选择是否药物流产还是人工流产。做药物流产以后应当及时复查，如果发现残留物需要尽快采取措施，药物治疗或者采取清宫。