子宫颈腺囊肿绝大多数是子宫颈生理性变化，子宫颈转化区内鳞状上皮取代柱状上皮的过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口，将腺管口阻塞，导致腺体分泌物引流受阻，形成囊肿，子宫颈腺囊肿通常不需处理，但深部的子宫颈腺囊肿，子宫颈表面无异常，表现子宫颈肥大，应与子宫颈腺癌鉴别。