巧克力囊肿通常很痛。大多数卵巢巧克力囊肿发生在黄体期或月经期。疼痛常常从一侧开始。正常子宫内膜生长在子宫腔，如果这是一个病态的子宫在盆腔的其他部分将增长，导致一系列的分泌和月经的变化，因此聚合成不同大小的结节，如这些结节一旦破裂，囊肿包含旧的血液扩散到腹腔，常常导致不孕症状，及时治疗，正确的治疗在于及时手术治疗。