卵巢囊肿不会影响卵巢的，卵巢囊肿，一般与卵巢没有什么直接的关系，不会影响到卵巢的。卵巢囊肿是良性的，比较小的。定期复查超声，观察囊肿生长，如果囊肿生长加快或出现不适等症状，需要进行手术治疗，切除组织送病理检查，以进一步明确病变性质。