巧克力囊肿的症状表现，有小腹疼痛，小腹不适，白带增多，白带色黄，白带异味，月经失常，而且通常小腹内有一个坚实而无痛的肿快，有时性交会发生疼痛。当囊肿影响到激素生产时，可能出现诸如阴道不规则出血或毛体增多等症状。较大的囊肿会对膀胱附近造成压迫，引起尿频和排尿困难。