由于引起功能性闭经的原因不同，所以治疗方法会有很大的差异。如果是由于垂体微腺瘤导致的闭经，服用药物来进行调理治疗，或者是行手术切除垂体微腺瘤。如果是由于多囊卵巢综合症，导致长期没有排卵而引起的闭经，这时候可以先服用黄体酮让月经来潮以后，再服用药物进行调理治疗。如果是由于卵巢早衰引起的闭经。