先天性的居多，病因不明确。与胰岛素抵抗和高胰岛素血症有关，胰岛素与胰岛素样生长因子存在于卵巢中，这些对卵泡与卵巢间质有影响，使卵巢分泌雄激素，阻碍正常卵泡发育。还有在胚胎时期卵巢发育不好，青春期后卵巢不能形成正常的卵子，或者卵泡发育到中途就停止发育，在卵巢上形成多囊，造成雌孕激素不能形成正常的周期性变化，继而造成内分泌异常。