子宫内膜薄的原因有内分泌严重失调，失调就会导致体内激素失衡，使子宫内膜周期性变化紊乱，导致子宫内膜薄。多次药流，或者人流动作过重都可能引起子宫内膜薄。子宫发育畸形也是子宫内膜薄的一个原因，有的子宫造影已经不是倒梨形了，甚至是细长条，这种因先天性畸形造成的子宫内膜薄很难治疗。