胚胎停育的原因包括：一、遗传因素。如果本身存在先天性遗传基因缺陷、染色体异常等问题时，就会增大发生胚胎停育的几率，常见的遗传基因缺陷主要是精子染色体异常或者卵子染色体异常。二、激素分泌不足。激素分泌不足也是一个导致胚胎停育的主要因素，激素分泌不足就会导致胚胎发育受到影响而造成停胎。三、子宫腔畸形。