是由于子宫内膜异位到盆腔内的卵巢、附件后，每次来月经期时，异位的子宫内膜细胞也少量出血，由腹膜包裹，再出血再包裹，月复一月的积聚，其间也由腹膜吸收一部分，剩下的变成一种陈旧性积血，颜色如同巧克力样地咖啡色，因而得名为巧克力囊肿。