症状有，月经不调，巧克力囊肿的人常有月经周期缩短以及经期延长等现象，性交疼痛，当存在于阴道穹窿部异位子宫内膜，或卵巢粘连在盆底时候，都可能产生性交疼痛；不孕巧克力囊肿患有不孕，是因为病变造成盆腔粘连、输卵管堵塞卵泡发育不好或排卵障碍等因素引起的。