遗传因素，比如染色体核型的异常、基因缺陷等，约占20%-25%；疾病造成的卵巢功能不全，比如感染性疾病、自身免疫性疾病可能损伤正常的卵巢组织，造成早发性卵巢功能不全；医源性因素，比如手术损伤了正常的卵巢组织，影响卵巢的血供，造成卵巢功能不全；不良环境，比如长期处于高辐射或有毒物质的环境。