对于不同致病菌造成的尿道炎，通常临床治疗方法也不一样。淋球菌感染引起的尿道炎，一般可以选用消炎药进行治疗。对于支原体、衣原体感染引起的非淋球菌性尿道炎，一般治疗方法可以选用抗生素进行治疗。由于尿道炎可以通过性接触的方式互相传播，所以在治疗期间一般要禁欲，可以避免交叉感染。