子宫内膜薄最大的危害就是导致不孕。子宫内膜的厚度和女性受孕有很重要的关系，会影响怀孕。如果子宫内膜太薄，受精卵很难着床，从而导致不孕不育的发生。女性即便怀孕也易发生流产。即便受精卵进入子宫，成功着床，但是由于没有足够的营养，还是会引发流产。