流产最主要的原因大部分都是胚胎染色体发育异常，主要是染色体数目异常比较多见。另外，母亲患有全身性疾病，如严重的感染、高热疾病、严重贫血、心力衰竭、血栓性疾病、慢性消耗性疾病、慢性肝肾疾病和高血压等也有可能会导致流产。如果母亲生殖器官异常，如子宫畸形、子宫发育不良、双角子宫、患有黏膜下子宫肌瘤、子宫腺肌瘤，都可以影响胚胎着床导致流产。