巧克力囊肿腹腔镜手术费用大约需要一万到一万五左右。不同的医院收费会有所不同，不同的地区收费也会有所差异。一般三甲医院的收费高于二甲医院，发达地区的收费高于落后地区。巧克力囊肿腹腔镜的手术还要根据手术时间的长短，以及手术的难易程度、术中腹腔是否有粘连以及麻醉药的用药多少、监护的时间等，考虑手术的费用综合。