巧克力囊肿并不是一定会复发的，这种疾病会有一定复发几率，只要病人做好预防复发的工作，也就不会出现反复发作的情形，首先要就诊专科医院进行手术，这样可以保证手术效果，只要切除囊肿就可以降低复发几率，其次要做好术后护理工作，术后饮食要合理搭配，不能过度劳累。