孕酮低和多囊卵巢有关系，不过多囊卵巢不一定都引起孕酮值低。多囊卵巢综合征会稀发排卵或者是不排卵，不排卵就没有孕激素的峰值，这两者之间有一定的关系。孕酮低的情况下易发生自然流产，为有效预防自然流产的发生，在孕酮低的情况下要及早治疗。